Huperzine A Complexed with Acetylcholinesterase (Chinese): Difference between revisions

分辨率为2.5埃的石杉碱甲与从加利福尼亚电鳐中提取的乙酰胆碱酯酶复合物的晶体结构于1997年测定（其在蛋白质库中的编码为'''1vot'''）。晶体结构表明石杉碱甲以非常出乎意料的取向与乙酰胆碱酯酶结合，与其对乙酰胆碱酯酶高亲合力性质相对应的是石杉碱甲与关键蛋白质残基形成了较强的相互作用。乙酰胆碱酯酶的催化活性位点位于其<scene name='1vot/Active_site/1'>狭长口袋</scene>的底部，<scene name='1vot/Active_site/2'>十四个芳香性残基</scene>坐落在整个口袋的内壁。乙酰胆碱酯酶的天然底物<scene name='1vot/Active_site/3'>乙酰胆碱</scene>与<scene name='1vot/Active_site/5'>催化三联体</scene>（Ser200, His440, and Glu327）之一的残基<scene name='1vot/Active_site/4'>Ser200</scene>直接键连。此外， <scene name='1vot/Active_site/6'>残基Trp84和Phe330</scene>对配体识别结合也非常重要。与乙酰胆碱相似，<font color='blueviolet'><b>石杉碱甲</b></font>也结合于乙酰胆碱酯酶的催化活性位点，其取向基本上与<font color='gray'><b>乙酰胆碱</b></font>的取向<scene name='1vot/Active_site/8'>垂直</scene>。<scene name='1vot/1vot_ache_interactions/1'>石杉碱甲与乙酰胆碱酯酶形成的主要相互作用</scene>包括：在口袋底部与<scene name='1vot/1vot_199_130_117/1'>残基Tyr130</scene>形成的直接氢键以及与<scene name='1vot/1vot_199_130_117/1'>残基Glu199和Gly117</scene>通过水分子作中介的氢键；与<scene name='1vot/1vot_84_330/1'>残基Trp84和Phe330</scene>形成像阳离子pi相互作用，其氨基氮原子与两残基芳香环的中心距离分别为4.8和4.7埃；在狭长口袋顶部，石杉碱甲通过两个水分子作中介分别与<scene name='1vot/1vot_70_72_81_85_121/2'>残基Tyr70，Asp72，Ser81，Asn85和Tyr121</scene>形成氢键相互作用。此外，特殊的氢键C-H→O相互作用在石杉碱甲的乙基和残基His440主链氧原子之间形成，其距离非常短，仅为3埃。