User:Eric Martz/Cavities tests: Difference between revisions

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Alignment produced by Swiss Model, used in making the 3D model:
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TARGET    55            R TFNRSGIRPL HQNCSFENYR VECEGQMNAL SKARQYVEEF
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2qgzA    100  qkqaais--e riqlvslpks yrhihlsdid vnnasrmeaf saildfveqy
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TARGET                    sssss    h h            hhhhhhh hhhhhhhhh  
TARGET                    sssss    h h            hhhhhhh hhhhhhhhh  
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2qgzA              hhh  h  sss    h h            hhhhhhh hhhhhhhhh  
2qgzA              hhh  h  sss    h h            hhhhhhh hhhhhhhhh  
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TARGET    96    DGN-IASFIF SGKPGTGKNH LAAAICNELL L-RGKSVLII TVADIMSAMK
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2qgzA    148  psaeqkglyl ygdmgigksy llaamahels ekkgvsttll hfpsfaidvk
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TARGET                ssss ss    hhh hhhhhhhhhh h h  ssss sshhhhhhh  
TARGET                ssss ss    hhh hhhhhhhhhh h h  ssss sshhhhhhh  
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2qgzA                ssss ss    hhh hhhhhhhhhh hh    ssss sshhhhhhh  
2qgzA                ssss ss    hhh hhhhhhhhhh hh    ssss sshhhhhhh  
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TARGET    144  DTFRNSGTSE EQLLNDLSNV DLLVIDEIGV QTESKYEKVI INQIVDRRSS
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2qgzA    198  naiske---- --eidavknv pvlilddiga vrde-----v lqvilqyrml
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                  /\                          / \
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TARGET                        hhh    ssssss              hhhhhhhhhh
TARGET                        hhh    ssssss              hhhhhhhhhh
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2qgzA                        hh  h    ssssss              hhhhhhhhhh
2qgzA                        hh  h    ssssss              hhhhhhhhhh
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TARGET    194  SKRPTGMLTN SNMEEMTKLL ---GERVMDR MRLGNSLWVI FNWDSYR   
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2qgzA    247  eelptfftsn ysfadlerkw awqakrvmer vr-ylarefh leganrr-   
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TARGET          h  ssssss    hhhhh          hhhh hh  ssssss s         
TARGET          h  ssssss    hhhhh          hhhh hh  ssssss s         
2qgzA          h  ssssss    hhhh          hhhh hh hh ssss s  
2qgzA          h  ssssss    hhhh          hhhh hh hh ssss s  
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