TRNA synthetases (Hebrew): Difference between revisions

← Older edit Newer edit →

Proteopedia Page Contributors and Editors (what is this?)Proteopedia Page Contributors and Editors (what is this?)

Stav Rom, Hila Genis

@@ Line 136: / Line 136: @@
   הינו דימר של אמינואציל tRNA ואלין עם שתי מולקולות tRNA מחוברות אליו. בסצנה זו תת יחידה אחת של החלבון צבועה בירוק והשנייה בתכלת. ה tRNA צבוע באדום וכחול על מנת להדגיש את מורכבות המבנה. בנוסף, מוצג מבנה מלא סטטי (<scene name='89/898979/Full_protein_view/2'>מבנה מלא-סטטי</scene>) בו ניתן לראות את המבנה כולל הפניות (חיצים) למרכיביו השונים.
 על מנת להציג את החלבון וה RNA בצורה ברורה משלב זה הסצנות מוצגות כ'''מונומר'''.
-חלבונים הם מולקולות פולימריות  המורכבות משרשרת של ח. אמינו.החלבונים מורכבים מצירופים שונים של 20 סוגי חומצות אמינו הנקשרות זו לזו בקשרים פפטידיים ליצירת החלבון.לכל חלבון רצף ייחודי של ח' אמינו  המתקפלות למבנה ייחודי. במקרים רבים כאשר מגבשים אנזים יש לעשות זאת עם מולקולות נוספות המתחברות אליהם. במקרה ספציפי זה ניתן לראות כי המבנה שגובש מכיל הן חלבון המורכב מח. אמינו תצוגת ח' אמינו (כחול) והן tRNA המורכב מחומצות געין (חום) (<scene name='89/898979/Amino_acid/6'>תצוגת חומצות אמינו</scene>)
+חלבונים הם מולקולות פולימריות  המורכבות משרשרת של ח. אמינו.החלבונים מורכבים מצירופים שונים של 20 סוגי חומצות אמינו הנקשרות זו לזו בקשרים פפטידיים ליצירת החלבון.לכל חלבון רצף ייחודי של ח' אמינו  המתקפלות למבנה ייחודי. במקרים רבים כאשר מגבשים אנזים יש לעשות זאת עם מולקולות נוספות המתחברות אליהם. במקרה ספציפי זה ניתן לראות כי המבנה שגובש מכיל הן חלבון המורכב מח. אמינו תצוגת ח' אמינו (כחול) והן tRNA המורכב מחומצות גרעין (חום) (<scene name='89/898979/Amino_acid/6'>תצוגת חומצות אמינו</scene>)
 משפחת האנזימים אמינואציל tRNA סינתטאז קושרות בנוסף גם ח. אמינית על מנת לבצע את פעילותו האנזימתית (ראה תפקיד האנזים). לכן אתר חשוב במבנה זה הינו
 אתר קישור ואלין בעמדה 81.(<scene name='89/898979/Valine_binding_site/1'>אתר קישור ואלין עמדה 81</scene>). בסצנה זו ניתן לראות את האנזים בצבע כחול ואת מולקולת ה tRNA בירוק. ניתן לראות בנוסף את אתר הקישור של ואלין (עמדה 81) מסומנת האדום.
-ישנם מבנים של חלבונים שיש בהם מוטיבים אשר חוזרים על עצמם פעמים רבות במבנה החלבון. אחד משני המוטיבים מרכזיים הינו מבנה  שניוני אלפא הליקס  (<scene name='89/898979/Alpha_helix_chains/1'>מבנה שניוני אלפא הליקס</scene>) במבנה החלבון ניתן לראות את האנזים בצבע כחול ואת מולקולת ה tRNA בירוק. מבנים שניוניים אשר מקופלים ל Alpha helix צבועים באדום. מוטיב מרכזי נוסף הינו מבנה שניוני בטא שיט(<scene name='89/898979/Beta_sheet/2'>מבנה שניוני בטא שיט</scene>). כאן ניתן לראות ניתן לראות את האנזים בצבע כחול ואת מולקולת ה tRNA בירוק. מבנים שניוניים אשר מקופלים ל Beta sheet צבועים באדום.
+ישנם מבנים של חלבונים שיש בהם מוטיבים אשר חוזרים על עצמם פעמים רבות במבנה החלבון. אחד משני המוטיבים מרכזיים הינו מבנה  שניוני אלפא הליקס  (<scene name='89/898979/Alpha_helix_chains/1'>מבנה שניוני אלפא הליקס</scene>) במבנה החלבון ניתן לראות את האנזים בצבע כחול ואת מולקולת ה tRNA בירוק. מבנים שניוניים אשר מקופלים ל Alpha helix צבועים באדום. מוטיב מרכזי נוסף הינו (<scene name='89/898979/Beta_sheet/2'>מבנה שניוני בטא שיט</scene>). כאן ניתן לראות ניתן לראות את האנזים בצבע כחול ואת מולקולת ה tRNA בירוק. מבנים שניוניים אשר מקופלים ל Beta sheet צבועים באדום.
 בנוסף למבנה החלבון, מבנה ה tRNA גם כן הינו ייחודי .מולקולת tRNA בצבע סגול. ניתן לראות את הבסיסים החנקניים (פורינים ופרימידינים) המרכיבים כל  RNA בתא. ניתן לראות זאת ב מבט על רנ''א (<scene name='89/898979/Trna_view/2'>מבט על ר.נ.א</scene>) בה האנזים בצבע כחול ואת מולקולת ה tRNA סגול.