Proteopedia

User:Adam Meade/Sandbox 1: Difference between revisions

← Older editNewer edit →
No edit summary
No edit summary
Line 1: Line 1:
'''''Iron Response Regulator (Irr)'''''
'''''Iron Response Regulator (Irr)'''''
----
----
=Background Information=
=Background Information=
Line 125: Line 127:




  POS SEQ     3LATOM SCORE COLOR CONFIDENCE INTERVAL CONFIDENCE INTERVAL COLORS MSA DATA RESIDUE VARIETY
  POS SEQ     COLOR RESIDUE VARIETY
                 (normalized)                        
                 (normalized)                        
   1   D     ASP33: -1.189   9 -1.455,-0.986     9,8   10/29 D                 
   1   D       9         D                 
   2   V     VAL34: 0.979   2* 0.016, 2.633     5,1   10/29 F,N,V,Y           
   2   V       2*         F,N,V,Y           
   3   N     ASN35: -0.318   6 -0.859, 0.016     8,5   14/29 A,N,S,T           
   3   N       6         A,N,S,T           
   4   E     GLU36: 0.737   3* 0.016, 1.214     5,1   19/29 E,G,K,Q,S,T       
   4   E       3* E,G,K,Q,S,T       
   5   M     MET37: 0.793   3* 0.016, 1.214     5,1   19/29 A,E,I,L,M,Q,T     
   5   M       3* A,E,I,L,M,Q,T     
   6   L     LEU38: -1.329   9 -1.588,-1.223     9,9   28/29 L                 
   6   L       9         L                 
   7   Q     GLN39: -0.531   7 -0.859,-0.210     8,6   28/29 K,Q,R             
   7   Q       7         K,Q,R             
   8   S     SER40: 2.423   1 2.633, 2.633     1,1   28/29 D,E,K,N,Q,R,S,T   
   8   S       1         D,E,K,N,Q,R,S,T   
   9   A     ALA41: 0.058   5 -0.403, 0.294     6,4   28/29 A,G,I,M,N,S,T,V   
   9   A       5         A,G,I,M,N,S,T,V   
   10   G     GLY42: -1.069   8 -1.338,-0.859     9,8   28/29 D,G               
   10   G       8         D,G               
   11   L     LEU43: -0.850   8 -1.223,-0.570     9,7   28/29 I,L,V             
   11   L       8         I,L,V             
   12   R     ARG44: -0.998   8 -1.223,-0.859     9,8   28/29 K,R               
   12   R       8         K,R               
   13   P     PRO45: 0.305   4 -0.210, 0.661     6,3   28/29 A,I,P,V,Y         
   13   P       4         A,I,P,V,Y         
   14   T     THR46: -1.473   9 -1.588,-1.455     9,9   28/29 T                 
   14   T       9         T                 
   15   R     ARG47: 0.816   3* 0.016, 1.214     5,1   28/29 E,F,G,K,L,P,R,V   
   15   R       3* E,F,G,K,L,P,R,V   
   16   Q     GLN48: -0.961   8 -1.223,-0.721     9,7   28/29 P,Q               
   16   Q       8         P,Q               
   17   R     ARG49: -1.426   9 -1.588,-1.338     9,9   28/29 R                 
   17   R       9         R                 
   18   M     MET50: 0.754   3* 0.016, 1.214     5,1   28/29 E,H,I,L,M,Q,V     
   18   M       3* E,H,I,L,M,Q,V     
   19   A     ALA51: -0.901   8 -1.223,-0.721     9,7   28/29 A,K,T,V           
   19   A       8         A,K,T,V           
   20   L     LEU52: -0.710   7 -0.986,-0.403     8,6   28/29 I,L,V             
   20   L       7         I,L,V             
   21   G     GLY53: -0.370   6 -0.859, 0.016     8,5   28/29 G,I,L,M           
   21   G       6         G,I,L,M           
   22   W     TRP54: 1.698   1 1.214, 2.633     1,1   28/29 A,D,E,K,N,Q,R,W   
   22   W       1         A,D,E,K,N,Q,R,W   
   23   L     LEU55: 1.226   1 0.661, 2.633     3,1   28/29 A,F,I,L,M,T,V,Y   
   23   L       1         A,F,I,L,M,T,V,Y   
   24   L     LEU56: -0.594   7 -0.986,-0.210     8,6   28/29 F,L,M,V           
   24   L       7         F,L,M,V           
   25   F     PHE57: 1.556   1 0.661, 2.633     3,1   28/29 D,E,F,I,K,N,Q,R,V,Y
   25   F       1         D,E,F,I,K,N,Q,R,V,Y
   26   G     GLY58: 2.434   1 2.633, 2.633     1,1   28/29 A,E,G,H,K,N,Q,S,T  
   26   G       1         A,E,G,H,K,N,Q,S,T  
   27   K     LYS59: 0.609   3* 0.016, 1.214     5,1   28/29 A,E,H,K,P,S,T     
   27   K       3* A,E,H,K,P,S,T     
   28   G     GLY60: 2.294   1 2.633, 2.633     1,1   29/29 A,D,E,G,H,K,M,P,R  
   28   G       1         A,D,E,G,H,K,M,P,R  
   29   A     ALA61: 2.262   1 2.633, 2.633     1,1   27/29 A,C,E,G,L,M,N,Q,S,T
   29   A       1         A,C,E,G,L,M,N,Q,S,T
   30   R     ARG62: 1.468   1 0.661, 2.633     3,1   19/29 E,H,Q,R           
   30   R       1         E,H,Q,R           
   31   H     HIS63: -1.467   9 -1.588,-1.455     9,9   29/29 H                 
   31   H       9         H                 
   32   L     LEU64: 0.771   3* 0.016, 1.214     5,1   29/29 A,F,I,L,M,P,V,Y   
   32   L       3* A,F,I,L,M,P,V,Y   
   33   T     THR65: -0.874   8 -1.107,-0.721     8,7   29/29 D,E,S,T           
   33   T       8         D,E,S,T           
   34   A     ALA66: -1.188   9 -1.338,-0.986     9,8   29/29 A,P,T             
   34   A       9         A,P,T             
   35   E     GLU67: -1.035   8 -1.338,-0.859     9,8   29/29 D,E               
   35   E       8         D,E               
   36   M     MET68: 0.707   3* 0.016, 1.214     5,1   29/29 A,D,E,H,M,S,T     
   36   M       3* A,D,E,H,M,S,T     
   37   L     LEU69: 0.078   5 -0.403, 0.294     6,4   29/29 C,I,L,V           
   37   L       5         C,I,L,V           
   38   Y     TYR70: -0.574   7 -0.986,-0.210     8,6   29/29 F,I,Y             
   38   Y       7         F,I,Y             
   39   E     GLU71: 0.157   5 -0.403, 0.661     6,3   29/29 E,G,K,M,N,Q,R     
   39   E       5         E,G,K,M,N,Q,R     
   40   E     GLU72: 1.498   1 0.661, 2.633     3,1   29/29 A,E,H,I,K,L,R     
   40   E       1         A,E,H,I,K,L,R     
   41   A     ALA73: -0.319   6 -0.721, 0.016     7,5   29/29 A,F,I,L,V         
   41   A       6         A,F,I,L,V         
   42   T     THR74: 1.036   2 0.294, 1.214     4,1   29/29 A,E,I,L,M,R,S,T   
   42   T       2         A,E,I,L,M,R,S,T   
   43   L     LEU75: 1.694   1 0.661, 2.633     3,1   29/29 A,D,E,F,G,L,N,P,S,V
   43   L       1         A,D,E,F,G,L,N,P,S,V
   44   A     ALA76: 2.302   1 2.633, 2.633     1,1   29/29 A,D,E,I,K,L,M,P,Q,R,S
   44   A       1         A,D,E,I,K,L,M,P,Q,R,S
   45   K     LYS77: 2.001   1 1.214, 2.633     1,1   29/29 D,F,G,H,K,L,N,S   
   45   K       1         D,F,G,H,K,L,N,S   
   46   V     VAL78: 0.670   3* 0.016, 1.214     5,1   29/29 C,E,L,M,P,S,V     
   46   V       3* C,E,L,M,P,S,V     
   47   P     PRO79: 0.328   4 -0.210, 0.661     6,3   29/29 D,E,N,P           
   47   P       4         D,E,N,P           
   48   V     VAL80: -0.744   7 -0.986,-0.570     8,7   29/29 I,M,V             
   48   V       7         I,M,V             
   49   S     SER81: -1.279   9 -1.455,-1.107     9,8   29/29 G,S               
   49   S       9         G,S               
   50   L     LEU82: -0.133   5 -0.570, 0.294     7,4   29/29 H,I,L,R,V         
   50   L     LEU82: -0.133   5 -0.570, 0.294     7,4   29/29 H,I,L,R,V         
   51   A     ALA83: -1.171   9 -1.338,-0.986     9,8   29/29 A,Q,S             
   51   A     ALA83: -1.171   9 -1.338,-0.986     9,8   29/29 A,Q,S             
Retrieved from "https://proteopedia.openfox.io/w/User:Adam_Meade/Sandbox_1"