Proteins: primary and secondary structure: Difference between revisions

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*'''प्राथमिक संरचना'''
*'''Primary structure'''
:*इसमें <scene name='60/603296/Primaria/2'>प्रारंभिक दृश्य</scene>में हम इसकी कुछ विशेषताओं का विश्लेषण करने के लिए एक पॉलीपेप्टाइड श्रृंखला का एक छोटा टुकड़ा देख सकते हैं''प्राथमिक संरचना''। चेन '' बैकबोन '' बनाने वाले परमाणुओं को ज़िग-ज़ैग में निपटाया जाता है, जैसा कि इसकी बॉन्डिंग ऑर्बिटल्स की ज्यामिति द्वारा आवश्यक होता है। एमिनो एसिड अवशेषों (या आर समूहों) की साइड चेन रीढ़ की हड्डी के बाहर की तरफ फैलती है।
:*In this <scene name='60/603296/Primaria/2'>initial view</scene> we can see a short fragment of a polypeptide chain in order to analyze some features of its ''primary structure''. Atoms forming the chain ''backbone'' are disposed in zig-zag, as required by geometry of its bonding orbitals. Side chains of amino acid residues (or R groups) protrude outwards either side of backbone.
:*चलो अब में चलते हैं <scene name='60/603296/Primaria3/1'>पेप्टाइड बंधन</scene> दो अमीनो एसिड अवशेषों के बीच। क्योंकि अनुनाद की घटना, पेप्टाइड बॉन्ड एक डबल बॉन्ड की कुछ विशेषताओं को दर्शाता है, जो किसी भी बंधन पक्ष पर परमाणुओं के मुक्त रोटेशन को रोकता है। तो, छह परमाणुओं को चिह्नित किया गया <scene name='60/603296/Primaria3/7'>आयत में</scene> जो मॉडल की खिड़की पर हमेशा एक ही कठोर फ्लैट तक सीमित होता है। हम इसका परीक्षण कर सकते हैं <scene name='60/603296/Primaria3/6'>रोटेशन को सक्रिय करें</scene>।
:*Let's go now to a <scene name='60/603296/Primaria3/1'>peptide bond</scene> between two amino acid residues. Because phenomenon of resonance, peptide bond shows some features of a double bond, which prevents free rotation of atoms on either bond side. So, six atoms marked in <scene name='60/603296/Primaria3/7'>rectangle</scene> on model window are always confined to the same rigid flat. We can test it by <scene name='60/603296/Primaria3/6'>activate rotation</scene>.
:*पॉलीपेप्टाइड श्रृंखला रीढ़ एक नीरस उत्तराधिकार में शामिल है जिसमें निम्नलिखित अनुक्रम दोहराता है: <scene name='60/603296/Primaria3/8'>अल्फ़ा कार्बन</scene>, <scene name='60/603296/Primaria3/9'>कार्बोक्सिल समूह कार्बन</scene>, <scene name='60/603296/Primaria3/11'>अमीनो समूह नाइट्रोजन</scene>। '' पेप्टाइड बॉन्ड '' में मुक्त घूमने के प्रतिबंधों को देखते हुए, हम पॉलीपेप्टाइड श्रृंखला की उत्तराधिकार के रूप में कल्पना कर सकते हैं <scene name='60/603296/Primaria3/12'>कठोर फ्लैट</scene>। इन कठोर फ्लैटों में से प्रत्येक स्वतंत्र रूप से एक-दूसरे का सम्मान कर सकते हैं।
:*Polypeptide chain backbone consist in a monotonous succession in wich the following sequenze repeats: <scene name='60/603296/Primaria3/8'>alpha carbon</scene>, <scene name='60/603296/Primaria3/9'>carboxyl group carbon</scene>, <scene name='60/603296/Primaria3/11'>amino group nitrogen</scene>. Minding the restrictions to free rotation in ''peptide bond'', we can visualize the polypeptide chain as a succession of <scene name='60/603296/Primaria3/12'>rigid flats</scene>. Each of these rigid flats can freely rotate respect each other.
 
*'''Secondary structure'''.- In most proteins there are two main types of secondary structure.
:*<scene name='60/603296/Secundaria/4'>Alpha helix</scene>.- It is a helical structure with a thread pitch of 0.56 nm. Let's go to a <scene name='60/603296/Secundaria/5'>polar view</scene>. Now let's <scene name='60/603296/Secundaria/7'>hide hydrogen atoms</scene>. The polypeptide chain backbone is coiled and placed at the center of structure, while amino acid side chains protrude outward from this backbone. Let's <scene name='60/603296/Secundaria/8'>hide side chains</scene> for a better understanding. Now, let's back to a <scene name='60/603296/Secundaria/10'>side view</scene>. A <scene name='60/603296/Secundaria/11'>ribbon model</scene> highlights the helical folding of the backbone. Using again a <scene name='60/603296/Secundaria/12'>ball and stick model</scene> we recover <scene name='60/603296/Secundaria/13'>side chains</scene>, now highlighted with a spectral color series. ''Alpha helix'' structure becomes stabilized by many <scene name='60/603296/Secundaria/14'>hydrogen bonds</scene>. All peptide groups in the chain are involved in these hydrogen bonds. <scene name='60/603296/Secundaria/15'>Zoom in</scene> to a better understanding.
:*Primary structure specifies secondary structure, i.e., is the amino acid sequence which determines that a polypeptide chain folds resulting in an alpha helix or other secondary structure. Let's consider the effects of <scene name='60/603296/Secundaria/20'>electrical charged residues</scene> of either sign and the <scene name='60/603296/Secundaria/21'>side chains size</scene>.
:*'''<scene name='60/603296/Secundaria2/1'>Beta sheet</scene>'''.- Polypeptide chain is folded in zigzag arrangement. Let's <scene name='60/603296/Secundaria2/2'>hide hydrogen atoms</scene> and <scene name='60/603296/Secundaria2/3'>side chains</scene> for a better understanding. Notice that a polypeptide chain can have several linear fragments separated by curvatures called ''beta turns''. Now let's recover <scene name='60/603296/Secundaria2/4'>side chains</scene> and highlight the <scene name='60/603296/Secundaria2/5'>hydrogen bonds</scene> between different linear sections of the chain. This hydrogen bonds give stability to the structure. Let's look now the polypeptide chain represented by a <scene name='60/603296/Secundaria2/6'>ribbon model</scene>.


*'''माध्यमिक संरचना''' ।- अधिकांश प्रोटीनों में दो मुख्य प्रकार की माध्यमिक संरचना होती है।
:*<scene name='60/603296/Secundaria/4'>अल्फा हेलिक्स</scene>.- यह एक पेचदार संरचना है जिसमें 0.56 एनएम की थ्रेड पिच होती है। आइए <scene name='60/603296/Secundaria/5'> एक ध्रुवीय दृश्य पर जाएं</scene>। चलिए अब <scene name='60/603296/Secundaria/7'>हाइड्रोजन परमाणुओं को छिपाएं</scene>। पॉलीपेप्टाइड चेन बैकबोन को ढाला जाता है और संरचना के केंद्र में रखा जाता है, जबकि एमिनो एसिड साइड चेन इस रीढ़ से बाहर की ओर फैलते हैं। चलो <scene name='60/603296/Secundaria/8'>साइड चेन छिपाएं</scene> एक बेहतर समझ के लिए। अब, चलो <scene name='60/603296/Secundaria/10'>साइड व्यू देखा जाय</scene>। ए <scene name='60/603296/Secundaria/11'>रिबन मॉडल</scene> रीढ़ की हड्डी के पेचदार तह को उजागर करता है। फिर से  <scene name='60/603296/Secundaria/12'>गेंद और छड़ी मॉडल का उपयोग करके</scene> हमें मिला <scene name='60/603296/Secundaria/13'>पक्ष श्रृंखला</scene>'' अल्फा हेलिक्स '' संरचना स्थिर हो जाती है<scene name='60/603296/Secundaria/14'>हाइड्रोजन बांड द्वारा</scene>। श्रृंखला के सभी पेप्टाइड समूह इन हाइड्रोजन बांडों में शामिल हैं। <scene name='60/603296/Secundaria/15'>आकार में वृद्धि करे</scene> एक बेहतर समझ के लिए।
:*प्राथमिक संरचना माध्यमिक संरचना को निर्दिष्ट करती है, अर्थात, अमीनो एसिड अनुक्रम है जो निर्धारित करता है कि एक पॉलीपेप्टाइड श्रृंखला सिलवटों में एक अल्फा हेलिक्स या अन्य माध्यमिक संरचना होती है। विचार करते हैं <scene name='60/603296/Secundaria/20'>विद्युत आवेशित अवशेष के प्रभावों पर</scene> जो की अलग संकेत(sign) के है<scene name='60/603296/Secundaria/21'>और पक्ष श्रृंखला आकार।</scene>।
:*'''<scene name='60/603296/Secundaria2/1'>बीटा शीट</scene>'''।- पॉलीपेप्टाइड श्रृंखला को ज़िगज़ैग व्यवस्था में मोड़ा जाता है। चलो <scene name='60/603296/Secundaria2/2'>हाइड्रोजन परमाणुओं को छिपाएं</scene> तथा<scene name='60/603296/Secundaria2/3'>पक्ष श्रृंखला को भी</scene> एक बेहतर समझ के लिए। ध्यान दें कि एक पॉलीपेप्टाइड श्रृंखला में कई रैखिक टुकड़े हो सकते हैं, जिन्हें '' बीटा घुमाव '' नामक वक्रता से अलग किया जाता है। अब <scene name='60/603296/Secundaria2/4'>अब साइड चेन्स को रिकवर करते हैं</scene> और प्रकाश डाला <scene name='60/603296/Secundaria2/5'>हाइड्रोजन बांड पर</scene> श्रृंखला के विभिन्न रैखिक वर्गों के बीच। यह हाइड्रोजन बांड संरचना को स्थिरता देते हैं। आइए अब देखें कि पॉलीपेप्टाइड श्रृंखला <scene name='60/603296/Secundaria2/6'>रिबन मॉडल का उपयोग करके द्वारा दर्शाई गई है</scene>।


== Files for 3D printer ==
<i class="fas fa-cubes"></i> An protein alpha helix in different representations by [[User:Marius Mihasan|Marius Mihasan]] [https://3dprint.nih.gov/discover/3dpx-014891  <i class="fas fa-download"></i>]
</StructureSection>
</StructureSection>
== संदर्भ ==
== References ==
<references/>
<references/>
[[Category:3D printer files]]

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Alejandro Porto, Joel L. Sussman, Dinesh Kulhary, Eric Martz, Jaime Prilusky, Meghan Wright
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